Merge pull request #242 from kbss-cvut/development

[3.0.0] Release

.github/workflows/push-to-protected.yml

@@ -20,10 +20,10 @@ jobs:
  # Steps represent a sequence of tasks that will be executed as part of the job
  steps:
  # Checks-out your repository under $GITHUB_WORKSPACE, so your job can access it
- - uses: actions/checkout@v2
- - uses: actions/setup-java@v2
+ - uses: actions/checkout@v3
+ - uses: actions/setup-java@v3
  with:
- java-version: '11'
+ java-version: '17'
  distribution: 'adopt'
 
  # Runs a set of commands using the runners shell

Dockerfile

@@ -1,4 +1,4 @@
-FROM maven:3-eclipse-temurin-11 as build
+FROM maven:3-eclipse-temurin-17 as build
 
 WORKDIR /termit
 
@@ -12,7 +12,7 @@ COPY src src
 
 RUN mvn package -B -P graphdb,standalone -DskipTests=true
 
-FROM eclipse-temurin:11-jdk-alpine as runtime
+FROM eclipse-temurin:17-jdk-alpine as runtime
 COPY --from=build /termit/target/termit.jar termit.jar
 
 EXPOSE 8080

README.md

@@ -13,7 +13,7 @@ An **asset** is an object of one of the main domain types managed by the system
 
 ## Required Technologies
 
-- JDK 11 or newer
+- JDK 17 or newer
 - Apache Maven 3.6.x or newer
 
 
@@ -30,7 +30,7 @@ See the [docs folder](doc/index.md) for additional information on implementation
 
 This section briefly lists the main technologies and principles used (or planned to be used) in the application.
 
-- Spring Boot 2, Spring Framework 5, Spring Security, Spring Data (paging, filtering)
+- Spring Boot 3, Spring Framework 6, Spring Security, Spring Data (paging, filtering)
 - Jackson 2.13
 - [JB4JSON-LD](https://github.com/kbss-cvut/jb4jsonld-jackson) - Java - JSON-LD (de)serialization library
 - [JOPA](https://github.com/kbss-cvut/jopa) - persistence library for the Semantic Web
@@ -77,7 +77,7 @@ Then, TermIt can be run and exposed at the port 8080 as
 
 An optional argument is `<GRAPHDB_REPOSITORY_URL>` pointing to the RDF4J/GraphDB repository.
 
-TermIt Docker images are also build and published to [DockerHub](https://hub.docker.com/r/kbsscvut/termit).
+TermIt Docker images are also published to [DockerHub](https://hub.docker.com/r/kbsscvut/termit).
 
 ## Links
 

ontology/termit-glosář.ttl

@@ -114,7 +114,7 @@ termit:glosář a owl:Ontology , <http://www.w3.org/2004/02/skos/core#Co
  owl:imports <http://onto.fel.cvut.cz/ontologies/slovník/agendový/popis-dat/glosář> , <https://slovník.gov.cz/datový/pracovní-prostor/glosář> , <http://rdfs.org/sioc/ns#> , <http://www.w3.org/ns/activitystreams#> , <http://purl.org/vocab/vann/> ;
  owl:versionIRI <http://onto.fel.cvut.cz/ontologies/application/termit/glosář/verze/1.1.2> ;
  <http://www.w3.org/2004/02/skos/core#hasTopConcept>
- termit-pojem:je-selektorem-definice-termu , termit-pojem:přiřazení-termu , termit-pojem:má-cíl , termit-pojem:selektor-definice , termit-pojem:je-přiřazením-termu , termit-pojem:má-suffix-text-quote , termit-pojem:záznam-o-textové-analýze , termit-pojem:má-přesný-text-quote , termit-pojem:selektor , termit-pojem:má-koncovou-pozici , termit-pojem:má-prefix-text-quote , termit-pojem:má-slovník-pro-analýzu , termit-pojem:uživatel-termitu , termit-pojem:cíl , termit-pojem:má-selektor , termit-pojem:má-zdroj-definice-termu , termit-pojem:má-analyzovaný-zdroj , termit-pojem:má-startovní-pozici, termit-pojem:je-draft .
+ termit-pojem:je-selektorem-definice-termu , termit-pojem:přiřazení-termu , termit-pojem:má-cíl , termit-pojem:selektor-definice , termit-pojem:je-přiřazením-termu , termit-pojem:má-suffix-text-quote , termit-pojem:záznam-o-textové-analýze , termit-pojem:má-přesný-text-quote , termit-pojem:selektor , termit-pojem:má-koncovou-pozici , termit-pojem:má-prefix-text-quote , termit-pojem:má-slovník-pro-analýzu , termit-pojem:uživatel-termitu , termit-pojem:cíl , termit-pojem:má-selektor , termit-pojem:má-zdroj-definice-termu , termit-pojem:má-analyzovaný-zdroj , termit-pojem:má-startovní-pozici , termit-pojem:úvodní-stav-pojmu , termit-pojem:koncový-stav-pojmu .
 
 termit-pojem:má-koncovou-pozici
  a <http://www.w3.org/2004/02/skos/core#Concept> ;
@@ -152,15 +152,6 @@ termit-pojem:má-zdroj-definice-termu
  <http://www.w3.org/2004/02/skos/core#prefLabel>
  "má zdroj definice termu"@cs .
 
-termit-pojem:je-draft
- a <http://www.w3.org/2004/02/skos/core#Concept> ;
- <http://www.w3.org/2004/02/skos/core#broader>
- <https://slovník.gov.cz/základní/pojem/vlastnost> , <https://slovník.gov.cz/základní/pojem/typ-vlastnosti> ;
- <http://www.w3.org/2004/02/skos/core#inScheme>
- termit:glosář ;
- <http://www.w3.org/2004/02/skos/core#prefLabel>
- "je draft"@cs .
-
 termit-pojem:selektor
  a <http://www.w3.org/2004/02/skos/core#Concept> ;
  <http://www.w3.org/2004/02/skos/core#broader>
@@ -497,8 +488,6 @@ termit-pojem:zakázaný
  <http://www.w3.org/2004/02/skos/core#prefLabel>
  "Forbidden"@en , "Zakázaný"@cs .
 
-# TODO consider moving this into a separate namespace (e.g., termit/rizeni-pristupu)
-
 termit-pojem:seznam-řízení-přístupu
  a <http://www.w3.org/2004/02/skos/core#Concept> ;
  <http://www.w3.org/2004/02/skos/core#broader>
@@ -624,3 +613,21 @@ termit-pojem:úroveň-přístupových-oprávnění
  termit:glosář ;
  <http://www.w3.org/2004/02/skos/core#prefLabel>
  "Access level - Security"@en , "Úroveň přístupových oprávnění - Správa"@cs .
+
+termit-pojem:úvodní-stav-pojmu
+ a <http://www.w3.org/2004/02/skos/core#Concept> ;
+ <http://www.w3.org/2004/02/skos/core#broader>
+ <https://slovník.gov.cz/základní/pojem/typ-objektu> ;
+ <http://www.w3.org/2004/02/skos/core#inScheme>
+ termit:glosář ;
+ <http://www.w3.org/2004/02/skos/core#prefLabel>
+ "Initial term state"@en , "Úvodní stav pojmu"@cs .
+
+termit-pojem:koncový-stav-pojmu
+ a <http://www.w3.org/2004/02/skos/core#Concept> ;
+ <http://www.w3.org/2004/02/skos/core#broader>
+ <https://slovník.gov.cz/základní/pojem/typ-objektu> ;
+ <http://www.w3.org/2004/02/skos/core#inScheme>
+ termit:glosář ;
+ <http://www.w3.org/2004/02/skos/core#prefLabel>
+ "Terminal term state"@en , "Koncový stav pojmu"@cs .

ontology/termit-model.ttl

@@ -51,19 +51,10 @@ termit-pojem:uživatel-termitu
 
 termit-pojem:má-zdroj-definice-termu
  a owl:ObjectProperty , <https://slovník.gov.cz/základní/pojem/typ-vztahu> ;
- rdfs:domain <http://onto.fel.cvut.cz/ontologies/slovník/agendový/popis-dat/pojem/term> ;
+ rdfs:domain <http://www.w3.org/2004/02/skos/core#Concept> ;
  rdfs:range termit-pojem:zdroj-definice-termu ;
  rdfs:subPropertyOf <https://slovník.gov.cz/základní/pojem/vztah> .
 
-termit-pojem:je-draft
- a owl:DatatypeProperty , <https://slovník.gov.cz/základní/pojem/typ-vlastnosti> ;
- rdfs:domain <http://onto.fel.cvut.cz/ontologies/slovník/agendový/popis-dat/pojem/term> ;
- rdfs:range xsd:boolean ;
- rdfs:subPropertyOf <https://slovník.gov.cz/základní/pojem/vlastnost> .
-
-<http://onto.fel.cvut.cz/ontologies/slovník/agendový/popis-dat/pojem/term>
- a owl:Class .
-
 termit-pojem:selektor
  a <https://slovník.gov.cz/základní/pojem/typ-objektu> , owl:Class ;
  rdfs:subClassOf <https://slovník.gov.cz/základní/pojem/objekt> .
@@ -109,7 +100,7 @@ termit-pojem:cíl a <https://slovník.gov.cz/základní/pojem/typ-objektu>
 termit-pojem:je-přiřazením-termu
  a owl:ObjectProperty , <https://slovník.gov.cz/základní/pojem/typ-vztahu> ;
  rdfs:domain termit-pojem:přiřazení-termu ;
- rdfs:range <http://onto.fel.cvut.cz/ontologies/slovník/agendový/popis-dat/pojem/term> ;
+ rdfs:range <http://www.w3.org/2004/02/skos/core#Concept> ;
  rdfs:subPropertyOf <https://slovník.gov.cz/základní/pojem/vztah> .
 
 termit-pojem:selektor-definice
@@ -334,3 +325,11 @@ termit-pojem:úroveň-přístupových-oprávnění
 
 <http://onto.fel.cvut.cz/ontologies/application/termit/pojem/úroveň-přístupových-oprávnění/správa>
  a owl:NamedIndividual .
+
+termit-pojem:úvodní-stav-pojmu
+ a <https://slovník.gov.cz/základní/pojem/typ-objektu>, owl:Class ;
+ rdfs:subClassOf <http://onto.fel.cvut.cz/ontologies/slovník/agendový/popis-dat/pojem/stav-pojmu> .
+
+termit-pojem:koncový-stav-pojmu
+ a <https://slovník.gov.cz/základní/pojem/typ-objektu>, owl:Class ;
+ rdfs:subClassOf <http://onto.fel.cvut.cz/ontologies/slovník/agendový/popis-dat/pojem/stav-pojmu> .

pom.xml

@@ -7,11 +7,11 @@
  <parent>
  <groupId>org.springframework.boot</groupId>
  <artifactId>spring-boot-starter-parent</artifactId>
- <version>2.7.12</version>
+ <version>2.7.13</version>
  </parent>
 
  <artifactId>termit</artifactId>
- <version>2.18.0</version>
+ <version>3.0.0</version>
  <name>TermIt</name>
  <description>Terminology manager based on Semantic Web technologies.</description>
  <packaging>${packaging}</packaging>
@@ -24,13 +24,13 @@
  </repositories>
 
  <properties>
- <java.version>11</java.version>
+ <java.version>17</java.version>
  <org.apache.tika.tika-core.version>2.7.0</org.apache.tika.tika-core.version>
  <org.mapstruct.version>1.5.5.Final</org.mapstruct.version>
  <org.springdoc.version>1.7.0</org.springdoc.version>
- <cz.cvut.kbss.jopa.version>0.22.1</cz.cvut.kbss.jopa.version>
- <cz.cvut.kbss.jsonld.version>0.12.3</cz.cvut.kbss.jsonld.version>
- <org.aspectj.version>1.9.7</org.aspectj.version>
+ <cz.cvut.kbss.jopa.version>1.1.0</cz.cvut.kbss.jopa.version>
+ <cz.cvut.kbss.jsonld.version>0.13.2</cz.cvut.kbss.jsonld.version>
+ <org.aspectj.version>1.9.19</org.aspectj.version>
 
  <!-- Default value for deployment type property which should otherwise specified on command line -->
  <deployment>DEV</deployment>
@@ -122,15 +122,15 @@
  <dependency>
  <groupId>org.eclipse.rdf4j</groupId>
  <artifactId>rdf4j-rio-rdfxml</artifactId>
- <version>3.7.7</version>
+ <version>4.3.2</version>
  </dependency>
 
 
  <!-- Spring declarative transactions with JOPA -->
  <dependency>
  <groupId>com.github.ledsoft</groupId>
  <artifactId>jopa-spring-transaction</artifactId>
- <version>0.1.5</version>
+ <version>0.2.0</version>
  </dependency>
 
  <!-- Spring -->
@@ -404,13 +404,6 @@
  </profile>
 
  <!-- Profiles for storages. Important for correct full text search functionality -->
- <profile>
- <id>rdf4j</id>
- <properties>
- <profile.name>rdf4j</profile.name>
- <spring.profiles.active>lucene</spring.profiles.active>
- </properties>
- </profile>
  <profile>
  <id>graphdb</id>
  <properties>
@@ -509,22 +502,32 @@
  <groupId>cz.cvut.kbss.jopa</groupId>
  <artifactId>jopa-maven-plugin</artifactId>
  <version>${cz.cvut.kbss.jopa.version}</version>
- <configuration>
- <package>cz.cvut.kbss.termit.util</package>
- <output-directory>${project.basedir}/src/main/generated-sources</output-directory>
- <ontology-iri>http://onto.fel.cvut.cz/ontologies/application/termit</ontology-iri>
- <mapping-file>${project.basedir}/src/main/resources/mapping</mapping-file>
- <whole-ontology-as-ics>true</whole-ontology-as-ics>
- <vocabulary-only>true</vocabulary-only>
- <ignore-failed-imports>true</ignore-failed-imports>
- </configuration>
  <executions>
  <execution>
  <id>generate-vocabulary</id>
  <phase>generate-sources</phase>
  <goals>
  <goal>owl2java-transform</goal>
  </goals>
+ <configuration>
+ <package>cz.cvut.kbss.termit.util</package>
+ <output-directory>${project.basedir}/src/main/generated-sources</output-directory>
+ <ontology-iri>http://onto.fel.cvut.cz/ontologies/application/termit</ontology-iri>
+ <mapping-file>${project.basedir}/src/main/resources/mapping</mapping-file>
+ <whole-ontology-as-ics>true</whole-ontology-as-ics>
+ <vocabulary-only>true</vocabulary-only>
+ <ignore-failed-imports>true</ignore-failed-imports>
+ </configuration>
+ </execution>
+ <execution>
+ <id>generate-static-metamodel</id>
+ <phase>generate-sources</phase>
+ <goals>
+ <goal>modelgen</goal>
+ </goals>
+ <configuration>
+ <source-package>cz.cvut.kbss.termit.model</source-package>
+ </configuration>
  </execution>
  </executions>
  </plugin>
@@ -564,7 +567,8 @@
  </goals>
  <configuration>
  <sources>
- <source>src/main/generated-sources</source>
+ <source>${project.basedir}/src/main/generated-sources</source>
+ <source>${project.build.directory}/generated-sources/static-metamodel/</source>
  </sources>
  </configuration>
  </execution>

profile/graphdb/query/fulltextsearch.rq

@@ -8,7 +8,7 @@ PREFIX rdf: <http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#>
 PREFIX rdfs: <http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#>
 PREFIX dc: <http://purl.org/dc/terms/>
 
-SELECT DISTINCT ?entity ?label ?vocabularyUri ?draft ?type ?snippetField ?snippetText ?score {
+SELECT DISTINCT ?entity ?label ?vocabularyUri ?state ?type ?snippetField ?snippetText ?score {
  {
  ?search a inst:label_index .
  }
@@ -33,7 +33,7 @@ SELECT DISTINCT ?entity ?label ?vocabularyUri ?draft ?type ?snippetField ?snippe
  ?entity ?inVocabulary ?vocabularyUri .
  }
  OPTIONAL {
- ?entity ?isDraft ?draft .
+ ?entity ?hasState ?state .
  }
  FILTER (?type = ?term || ?type = ?vocabulary)
  FILTER NOT EXISTS { ?entity a ?snapshot . }