Skip to content

预装有 Python3,C,Fortan,Grads,Julia,R内核,Metpy,Siphon,atmos,basemap,ncl_to_Python,Cartopy,ecmwf-api,netCDF4等常用包的 Jupyterlab 镜像。Docker images of Jupyterlab with Python3, C, Fortan, Grads, Julia, R and Metpy, Siphon, atmos, basemap, ncl_to_Python, Cartopy, geoplot, ecmwf-api.

License

Notifications You must be signed in to change notification settings

Bugatti100Peagle/jupyter-For-Atmospheric-Scientists

Repository files navigation

jupyter For Atmospheric Scientists

介绍

Jupyterlab 镜像预装 Python3,C,Fortan,Grads,Julia,R内核,Metpy,Siphon,atmos,basemap,ncl_to_Python,Cartopy,ecmwf-api,netcdf等常用包。

Docker images of Jupyterlab with Python3, C, Fortan, Grads, Julia, R and Metpy, Siphon, atmos, basemap, ncl_to_Python, Cartopy, ecmwf-api.

使用截图

https://img.bugatii100peagle.cn/2020/02/18/44d5d10d73152.png https://img.bugatii100peagle.cn/2020/02/18/362d47fcfb311.png
https://img.bugatii100peagle.cn/2020/02/18/36c7dd118359b.png https://img.bugatii100peagle.cn/2020/02/18/ec9bbcf04edf9.png

无需复杂设置与安装,开包即用。(PS:尤其是Basemap,简直是气象人的噩梦)

安装教程

服务器要求,至少1 vCPU 2 GiB,已配置网络环境,安全组开放8000端口。(也可以是其他端口,注意修改run命令即可)

推荐用宝塔面板安装。

1. 下载并安装Docker ce

卸载旧版本Docker

sudo apt-get remove docker docker-engine docker.io

安装包以允许通过HTTPS使用存储库

sudo apt-get install \
    apt-transport-https \
    ca-certificates \
    curl \
    software-properties-common

添加Docker的官方GPG密钥

curl -fsSL https://download.docker.com/linux/ubuntu/gpg | sudo apt-key add -

确认指纹

sudo apt-key fingerprint 0EBFCD88

设置稳定存储库,默认最新版

sudo add-apt-repository \
   "deb [arch=amd64] https://download.docker.com/linux/ubuntu \
   $(lsb_release -cs) \
   stable"

再次更新apt包索引

sudo apt-get update

安装最新版本的Docker CE

sudo apt-get install docker-ce

查看Docker CE 版本

docker -v

2. 拉取阿里云镜像

已打包七种镜像可供选择,如下:

镜像名 大小 Python3 C Grads Julia R Metpy Siphon atmos basemap ncl_to_Python Cartopy ecmwf-api netcdf Fortan
jupytercgmsabefcn:v1 3.001 GB
jupytercgrads_metpy_siphon_atmos_nal_ecmwf_fortran:v1 2.600 GB
jupytercgrads:1 1.871 GB
jupytercgrads_metpy_siphon_atmos:v1 1.978 GB
jupytercgrads_metpy_siphon_atmos_basemap:v1 2.794 GB
jupytercgrads_metpy_siphon_atmos_basemap_ecmwf_fortran:v1 2.794 GB
jupytercgrads_metpy_siphon_atmos_basemap_ecmwf_fortran_cartopy:v1 2.959 GB

本教程以装有Basemap和netCDF4的jupytercgmsabefcn为例,拉取链接为docker pull registry.cn-shanghai.aliyuncs.com/bugatii100peagle/镜像名:版本

docker pull registry.cn-shanghai.aliyuncs.com/bugatii100peagle/jupytercgmsabefcn:v1

3. 运行镜像

本地新建文件夹jupyterlabjupyterlab/workspace

docker run --name jupytercgmsabefcn -d -p 8000:8888 -v `pwd`/jupyterlab:/workspace -w /workspace -e GRANT_SUDO=yes --user root registry.cn-shanghai.aliyuncs.com/bugatii100peagle/jupytercgmsabefcn jupyter-lab --no-browser --port=8888 --ip=0.0.0.0 --allow-root

使用说明

浏览器打开http://IP:8000,密码是空密码,直接回车即可。

https://img.bugatii100peagle.cn/2020/02/20/442292d9a302a.png

TODO 接下来要做

  • 1. 国际化本项目文档。
  • 2. 收集更多常用工具集成。
  • 3. 试图解决NCL与Basemap的冲突,设置虚拟环境,集成到一个镜像。
  • 4. 修复低版本Grads无法打开.nc文件的问题。

参与项目

欢迎下载镜像使用,如果你觉得不错就给个星吧。

如果你有什么需求建议,可以在issue中以需求:xxx的形式给出。

如果你安装遇到问题,可以在issue中以问题:xxx的形式给出,并标明宿主机环境,报错信息等。

从裸奔的Jupyter镜像安装的详细方法,可参考我的博文气象人的Jupyterlab.

打赏

https://bugatii100peaglepics.oss-cn-qingdao.aliyuncs.com/HexoTheme/img/WX_cr.png https://bugatii100peaglepics.oss-cn-qingdao.aliyuncs.com/HexoTheme/img/ZFB_cr.jpg

About

预装有 Python3,C,Fortan,Grads,Julia,R内核,Metpy,Siphon,atmos,basemap,ncl_to_Python,Cartopy,ecmwf-api,netCDF4等常用包的 Jupyterlab 镜像。Docker images of Jupyterlab with Python3, C, Fortan, Grads, Julia, R and Metpy, Siphon, atmos, basemap, ncl_to_Python, Cartopy, geoplot, ecmwf-api.

Topics

Resources

License

Stars

Watchers

Forks

Releases

No releases published

Packages

No packages published